我的E政府‧電子化政府入口網搜尋服務有提供「我的E政府站內搜尋」、「政府公開資訊搜尋」搜尋內容選項讓民眾選擇。 「我的E政府站內搜尋」則包含交通速派、台灣看看透、主題館我的入口網及部落格等多項 E政府服務內容。「政府公開資訊搜尋」則包含機關網頁（包含政府（.gov）與教育研究（.edu）網頁）、機關聯絡方式、施政計畫、政府出版品、公務出國報告、政府公報及全國檔案目錄等搜尋。 並提供簡便的搜尋操作介面，歡迎民眾充分利用。 除了直接輸入欲查詢的關鍵字，來取得您需要相關結果清單。系統也支援布林運算 "and" "or" "not"查詢功能，例如：民眾也可以輸入 "政府 and 機關" 來找尋包含全部關鍵字的資料。 或者是輸入 "政府 or 機關" 來取得只包含任一個關鍵字以上的結果。也可以輸入"政府 and not 機關"來找尋內容包含"政府"，但不包含"機關"的資料。藉由不同條件的查詢方式，可以來得到更為精準的結果出現。惟「政府公開資訊搜尋」中除機關網頁搜尋有完整支援上述的布林運算外，其餘搜尋並不支援。